MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum 16

Total Repeats: 59860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021514	GAA	3	9	241	249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513839885
2	NC_021514	GA	3	6	264	269	50 %	0 %	50 %	0 %	513839885
3	NC_021514	ACA	2	6	306	311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513839885
4	NC_021514	CAA	2	6	314	319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513839885
5	NC_021514	GAAAC	2	10	346	355	60 %	0 %	20 %	20 %	513839885
6	NC_021514	GAA	2	6	436	441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513839885
7	NC_021514	GTT	2	6	462	467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513839885
8	NC_021514	GAAT	2	8	582	589	50 %	25 %	25 %	0 %	513839885
9	NC_021514	TAAT	2	8	590	597	50 %	50 %	0 %	0 %	513839885
10	NC_021514	A	6	6	610	615	100 %	0 %	0 %	0 %	513839885
11	NC_021514	AGG	2	6	617	622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	513839885
12	NC_021514	GAA	2	6	631	636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513839885
13	NC_021514	TTA	2	6	655	660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513839885
14	NC_021514	CGA	2	6	663	668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513839885
15	NC_021514	T	6	6	676	681	0 %	100 %	0 %	0 %	513839885
16	NC_021514	AAG	2	6	701	706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513839885
17	NC_021514	TTC	2	6	709	714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513839885
18	NC_021514	GAT	2	6	739	744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513839885
19	NC_021514	CGAA	2	8	776	783	50 %	0 %	25 %	25 %	513839885
20	NC_021514	AAT	2	6	1009	1014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513839885
21	NC_021514	ACC	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513839885
22	NC_021514	GAAA	2	8	1151	1158	75 %	0 %	25 %	0 %	513839885
23	NC_021514	ACTG	2	8	1212	1219	25 %	25 %	25 %	25 %	513839885
24	NC_021514	TGG	2	6	1251	1256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513839885
25	NC_021514	A	6	6	1376	1381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021514	CTA	2	6	1473	1478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021514	TAC	2	6	1480	1485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021514	TAT	2	6	1493	1498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021514	AT	4	8	1501	1508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021514	TCA	2	6	1574	1579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513839886
31	NC_021514	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513839886
32	NC_021514	ACC	2	6	1708	1713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513839886
33	NC_021514	TGA	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513839886
34	NC_021514	CAA	2	6	1731	1736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513839886
35	NC_021514	A	7	7	1800	1806	100 %	0 %	0 %	0 %	513839886
36	NC_021514	AGA	2	6	1812	1817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513839886
37	NC_021514	AAT	2	6	2125	2130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513839886
38	NC_021514	ATG	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513839886
39	NC_021514	GAT	2	6	2181	2186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513839886
40	NC_021514	AAT	2	6	2194	2199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513839886
41	NC_021514	CAG	2	6	2357	2362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513839886
42	NC_021514	AAT	2	6	2401	2406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513839886
43	NC_021514	ACGATT	2	12	2440	2451	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	513839886
44	NC_021514	AAC	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513839886
45	NC_021514	AAG	2	6	2552	2557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513839886
46	NC_021514	CGTT	2	8	2563	2570	0 %	50 %	25 %	25 %	513839886
47	NC_021514	GAA	2	6	2635	2640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513839886
48	NC_021514	AATA	2	8	2693	2700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021514	TAAA	2	8	2709	2716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021514	GAT	2	6	2798	2803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021514	ATATT	2	10	2830	2839	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021514	GCT	2	6	2841	2846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021514	CTA	2	6	2879	2884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021514	TGA	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021514	CGCT	2	8	2934	2941	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021514	AATG	2	8	2949	2956	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021514	A	6	6	2982	2987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021514	TTA	2	6	2997	3002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021514	TCA	2	6	3115	3120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021514	A	6	6	3120	3125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021514	TATAA	2	10	3130	3139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021514	GT	4	8	3150	3157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021514	AT	3	6	3239	3244	50 %	50 %	0 %	0 %	513839887
64	NC_021514	CAT	2	6	3275	3280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513839887
65	NC_021514	GGT	2	6	3288	3293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513839887
66	NC_021514	AAC	2	6	3317	3322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513839887
67	NC_021514	GTTA	2	8	3326	3333	25 %	50 %	25 %	0 %	513839887
68	NC_021514	GAT	2	6	3345	3350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513839887
69	NC_021514	CGG	2	6	3351	3356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513839887
70	NC_021514	TTGAAG	2	12	3385	3396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513839887
71	NC_021514	T	6	6	3408	3413	0 %	100 %	0 %	0 %	513839887
72	NC_021514	CACCG	2	10	3597	3606	20 %	0 %	20 %	60 %	513839888
73	NC_021514	AATT	2	8	3619	3626	50 %	50 %	0 %	0 %	513839888
74	NC_021514	ACC	2	6	3636	3641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513839888
75	NC_021514	GCG	2	6	3707	3712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513839888
76	NC_021514	AGCG	2	8	3718	3725	25 %	0 %	50 %	25 %	513839888
77	NC_021514	ATC	2	6	3733	3738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513839888
78	NC_021514	TATGGA	2	12	3845	3856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513839888
79	NC_021514	AAC	2	6	3916	3921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513839888
80	NC_021514	GCA	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513839888
81	NC_021514	ATC	2	6	4017	4022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513839888
82	NC_021514	GCA	2	6	4043	4048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513839888
83	NC_021514	GTCG	2	8	4148	4155	0 %	25 %	50 %	25 %	513839888
84	NC_021514	CAA	3	9	4191	4199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513839888
85	NC_021514	TTA	2	6	4227	4232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513839888
86	NC_021514	GAT	2	6	4245	4250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513839888
87	NC_021514	CAA	2	6	4302	4307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513839888
88	NC_021514	TGA	2	6	4348	4353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513839888
89	NC_021514	TTA	3	9	4380	4388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513839888
90	NC_021514	CTG	2	6	4431	4436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513839888
91	NC_021514	ATTA	2	8	4502	4509	50 %	50 %	0 %	0 %	513839888
92	NC_021514	GAG	2	6	4551	4556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	513839888
93	NC_021514	CGAAAA	2	12	4570	4581	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	513839889
94	NC_021514	ATG	2	6	4611	4616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513839889
95	NC_021514	ACG	2	6	4682	4687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513839889
96	NC_021514	CCA	2	6	4702	4707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513839889
97	NC_021514	TTG	2	6	4722	4727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513839889
98	NC_021514	TGA	2	6	4738	4743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513839889
99	NC_021514	ATA	2	6	4791	4796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513839889
100	NC_021514	A	6	6	4845	4850	100 %	0 %	0 %	0 %	513839889
101	NC_021514	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513839889
102	NC_021514	GGT	2	6	4907	4912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513839889
103	NC_021514	TGG	2	6	4930	4935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513839889
104	NC_021514	GTT	2	6	4958	4963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513839889
105	NC_021514	ATC	2	6	4972	4977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513839889
106	NC_021514	TTA	2	6	5014	5019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513839889
107	NC_021514	TGA	2	6	5077	5082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513839889
108	NC_021514	CGG	2	6	5094	5099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513839889
109	NC_021514	ACC	2	6	5138	5143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513839889
110	NC_021514	GAC	2	6	5161	5166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513839889
111	NC_021514	TGA	2	6	5230	5235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513839889
112	NC_021514	ATAAGA	2	12	5295	5306	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	513839889
113	NC_021514	GTTGC	2	10	5366	5375	0 %	40 %	40 %	20 %	513839889
114	NC_021514	GAC	2	6	5384	5389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513839889
115	NC_021514	TGA	2	6	5403	5408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513839889
116	NC_021514	CAA	2	6	5416	5421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513839889
117	NC_021514	TACG	2	8	5428	5435	25 %	25 %	25 %	25 %	513839889
118	NC_021514	GAA	2	6	5450	5455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513839889
119	NC_021514	TCA	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513839889
120	NC_021514	TTG	2	6	5510	5515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513839889
121	NC_021514	TGT	2	6	5569	5574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513839889
122	NC_021514	GCA	2	6	5645	5650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513839889
123	NC_021514	GCT	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513839889
124	NC_021514	A	6	6	5785	5790	100 %	0 %	0 %	0 %	513839889
125	NC_021514	ACA	2	6	5832	5837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513839889
126	NC_021514	GTA	2	6	5838	5843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513839889
127	NC_021514	GTT	2	6	5863	5868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513839889
128	NC_021514	GAA	2	6	5999	6004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513839889
129	NC_021514	GGT	2	6	6041	6046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513839889
130	NC_021514	ATTA	2	8	6079	6086	50 %	50 %	0 %	0 %	513839889
131	NC_021514	GTT	2	6	6139	6144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513839889
132	NC_021514	ACC	2	6	6196	6201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513839889
133	NC_021514	GAA	2	6	6251	6256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513839889
134	NC_021514	TGAG	2	8	6258	6265	25 %	25 %	50 %	0 %	513839889
135	NC_021514	GTT	2	6	6299	6304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513839889
136	NC_021514	GCG	2	6	6373	6378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513839889
137	NC_021514	TGA	2	6	6394	6399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513839889
138	NC_021514	TCT	2	6	6423	6428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513839889
139	NC_021514	GT	3	6	6511	6516	0 %	50 %	50 %	0 %	513839889
140	NC_021514	AGG	2	6	6641	6646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021514	ACGT	2	8	6771	6778	25 %	25 %	25 %	25 %	513839890
142	NC_021514	CGG	2	6	6800	6805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513839890
143	NC_021514	AAG	2	6	6854	6859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513839890
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145	NC_021514	ATC	2	6	6894	6899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513839890
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150	NC_021514	AT	3	6	7456	7461	50 %	50 %	0 %	0 %	513839890
151	NC_021514	ATG	2	6	7539	7544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513839890
152	NC_021514	CGG	2	6	7583	7588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513839890
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157	NC_021514	TAGC	2	8	8034	8041	25 %	25 %	25 %	25 %	513839890
158	NC_021514	ATT	2	6	8060	8065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513839890
159	NC_021514	GAA	2	6	8069	8074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513839890
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183	NC_021514	ATT	2	6	9281	9286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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234	NC_021514	GTG	2	6	11102	11107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
235	NC_021514	GGT	2	6	11158	11163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_021514	GACCA	2	10	11515	11524	40 %	0 %	20 %	40 %	513839894
243	NC_021514	CGA	2	6	11645	11650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513839894
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252	NC_021514	GTG	2	6	12116	12121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513839894
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258	NC_021514	TGA	2	6	12417	12422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513839894
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266	NC_021514	CAA	2	6	12832	12837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513839894
267	NC_021514	ATC	2	6	12875	12880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513839894
268	NC_021514	GAT	2	6	12934	12939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513839894
269	NC_021514	CGG	2	6	12959	12964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513839894
270	NC_021514	GCT	2	6	12970	12975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513839894
271	NC_021514	TAT	2	6	12983	12988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513839894
272	NC_021514	CAT	2	6	13007	13012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513839894
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274	NC_021514	GTG	2	6	13103	13108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513839894
275	NC_021514	TGC	2	6	13125	13130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513839894
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277	NC_021514	TTGA	2	8	13174	13181	25 %	50 %	25 %	0 %	513839894
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279	NC_021514	GAGT	2	8	13225	13232	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
280	NC_021514	T	7	7	13247	13253	0 %	100 %	0 %	0 %	513839895
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289	NC_021514	AAC	2	6	13708	13713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513839896
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323	NC_021514	TTGG	2	8	15227	15234	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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381	NC_021514	T	7	7	18693	18699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
382	NC_021514	G	6	6	18710	18715	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
383	NC_021514	CTT	2	6	18739	18744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
384	NC_021514	AGC	2	6	18807	18812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
385	NC_021514	ATCTT	2	10	18908	18917	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
386	NC_021514	GGA	2	6	18938	18943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
387	NC_021514	ATG	3	9	18947	18955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513839900
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390	NC_021514	TCA	2	6	19103	19108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
391	NC_021514	A	7	7	19115	19121	100 %	0 %	0 %	0 %	513839901
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395	NC_021514	CAG	2	6	19196	19201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513839901
396	NC_021514	TAA	2	6	19249	19254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513839901
397	NC_021514	CGA	2	6	19258	19263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513839901
398	NC_021514	GTC	2	6	19355	19360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513839901
399	NC_021514	TAA	2	6	19369	19374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513839901
400	NC_021514	A	6	6	19426	19431	100 %	0 %	0 %	0 %	513839901
401	NC_021514	AAG	2	6	19547	19552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513839901
402	NC_021514	AAAC	2	8	19663	19670	75 %	0 %	0 %	25 %	513839901
403	NC_021514	CT	3	6	19721	19726	0 %	50 %	0 %	50 %	513839901
404	NC_021514	GAA	2	6	19783	19788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513839901
405	NC_021514	TAT	3	9	19793	19801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513839901
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422	NC_021514	TCAG	2	8	20729	20736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
423	NC_021514	ATT	2	6	20743	20748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_021514	A	6	6	20788	20793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
425	NC_021514	T	6	6	20798	20803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
426	NC_021514	T	7	7	20809	20815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
427	NC_021514	ATA	2	6	20911	20916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
428	NC_021514	TAAG	2	8	20955	20962	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
429	NC_021514	CTT	2	6	20998	21003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
430	NC_021514	ATA	2	6	21004	21009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NC_021514	AAAC	2	8	21065	21072	75 %	0 %	0 %	25 %	513839902
432	NC_021514	ATGA	2	8	21080	21087	50 %	25 %	25 %	0 %	513839902
433	NC_021514	GTT	2	6	21209	21214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513839902
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435	NC_021514	CGAA	2	8	21379	21386	50 %	0 %	25 %	25 %	513839902
436	NC_021514	GTT	2	6	21407	21412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513839902
437	NC_021514	GAA	2	6	21460	21465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513839902
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499	NC_021514	ATT	2	6	24661	24666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513839904
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